Puesto que la luz y la oscuridad han de permanecer en equilibrio, el Maestro Xehanort quiere iniciar una guerra contra la "tiranía de la luz" para restaurar el equilibrio. En un esfuerzo de desbaratar los planes de Xehanort, Sora, Donald y Goofy buscan a los 7 guardianes de la luz y a la "Llave para devolver corazones", mientras que el Rey Mickey y Riku buscan a los anteriores portadores de Llaves espada.